Utilizando a mesma engine do primeiro game, a Ubisoft lançou Rainbow Six: Rogue Spear em 1999 para PC, PS1 e Dreamcast. O game trazia uma trama que envolvia os acontecimentos após a queda da União Soviética e o crescimento da Máfia russa.

O jogo foi bem aceito pelo público e crítica, recebendo ótimas notas e prêmios pela sua história e gameplay.

Rainbow Six: Raven Shield foi o primeiro game da série a utilizar uma nova engine, a Unreal 2.0, e chegar também ao PS2, Gamecube e Xbox. Um ponto interessante é que, mesmo sendo lançado com nome similar nos consoles e utilizar a mesma engine e elementos gráficos, porções do gameplay, além de toda a história são diferentes da vista nos PCs.

Mesmo sendo jogos parecidos, mas ainda diferentes, ambas as versões foram bastante elogiadas, mantendo assim o bom nome da série na nova geração.

Lançado em 2005 para PC, Xbox, PS2 e Gamecube, Rainbow Six: Lockdown foi o primeiro caso da série em que as versões de console foram lançadas antes que a de PC. Novamente, o game colocava a equipe Rainbow tentando desmantelar uma organização que tentava acabar com nações do Ocidente ao disseminar um vírus letal.

Mudanças no gameplay, além da confusão entre as versões de PC e consoles acabaram por tornar Lockdown um game controverso da franquia, mostrando que o público não estava tão empolgado com a série como antes.

Lançado em 2006 para PC, PS3 e Xbox 360, o game marcava a entrada da franquia em uma nova geração, trazendo também mudanças no gameplay, como a então comum forma de recuperar vida apenas evitando de levar dano por um período.

Com uma trama que acaba por separar o personagem controlável do resto da equipe, Rainbow Six Vegas se assemelha em vários momentos de outros títulos de tiro em primeira pessoa, focando ainda mais na ação do que no pensamento estratégico. Essa mudança deu um novo fôlego para a franquia, sendo bem aceito por fãs e crítica. O game eventualmente ganharia uma sequência que também recebeu boa aceitação.

Rainbow 6 Patriots prometia ser um dos jogos mais interessantes da franquia, colocando o jogador na pele de um agente infiltrado que se vê acusado como o causador de um grande ataque terrorista. Revelado em conferências ao redor do mundo pela Ubisoft, o game seria lançado para PC e a então futura geração de consoles, com versões para PS4 e Xbox One.

O problema é que várias divergências sobre a nova direção da franquia acabou por dificultar o desenvolvimento do título, fazendo com que eventualmente, Patriots fosse cancelado pela Ubisoft e os esforços dos desenvolvedores fossem voltados para outro capítulo da série.

Lançado em 2015 para PC, Xbox One e PS4, Rainbow Six: Siege inicialmente pareceu estranho aos fãs da série, já que ele não conta mais com uma campanha single player, focando mesmo no combate entre equipes anti-terrorismo e bandidos internacionais, em disputas online.

Eventualmente, a Ubisoft foi tratando com atenção pelos pedidos da comunidade que clamava por melhorias, trabalhando constantemente para deixar o game cada vez mais competitivo e divertido. Hoje, Rainbow Six Siege pode ser considerado um dos títulos mais fortes no cenário de eSports, com campeonatos mundiais que movimentam milhares de dólares.